Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Champ1Q8K327 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Champ1Q8K327 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Champ1Q8K327 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Champ1Q8K327 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Champ1Q8K327 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Champ1Q8K327 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Champ1Q8K327 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Champ1Q8K327 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Champ1Q8K327 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Champ1Q8K327 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Champ1Q8K327 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Champ1Q8K327 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Champ1Q8K327 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Champ1Q8K327 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Champ1Q8K327 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Champ1Q8K327 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Champ1Q8K327 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Champ1Q8K327 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Champ1Q8K327 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Champ1Q8K327 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Champ1Q8K327 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Champ1Q8K327 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Champ1Q8K327 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Champ1Q8K327 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Champ1Q8K327 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Champ1Q8K327 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Champ1Q8K327 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Champ1Q8K327 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Champ1Q8K327 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Champ1Q8K327 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Champ1Q8K327 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Champ1Q8K327 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Champ1Q8K327 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Champ1Q8K327 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Champ1Q8K327 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Champ1Q8K327 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Champ1Q8K327 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Champ1Q8K327 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Champ1Q8K327 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Champ1Q8K327 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Champ1Q8K327 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Champ1Q8K327 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Champ1Q8K327 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Champ1Q8K327 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Champ1Q8K327 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Champ1Q8K327 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Champ1Q8K327 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Champ1Q8K327 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Champ1Q8K327 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms