Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccm2Q8K2Y9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccm2Q8K2Y9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccm2Q8K2Y9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccm2Q8K2Y9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccm2Q8K2Y9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccm2Q8K2Y9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccm2Q8K2Y9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccm2Q8K2Y9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms