Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms