Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo4Q8CHQ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo4Q8CHQ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fbxo4Q8CHQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo4Q8CHQ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo4Q8CHQ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms