Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap29Q8CGF1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap29Q8CGF1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap29Q8CGF1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap29Q8CGF1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap29Q8CGF1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap29Q8CGF1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms