Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

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Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4lQ8CFI0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4lQ8CFI0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd4lQ8CFI0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd4lQ8CFI0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4lQ8CFI0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4lQ8CFI0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4lQ8CFI0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd4lQ8CFI0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd4lQ8CFI0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd4lQ8CFI0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms