Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Hpf1Q8CFE2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hpf1Q8CFE2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hpf1Q8CFE2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hpf1Q8CFE2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpf1Q8CFE2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hpf1Q8CFE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms