Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC62

Teddm1b, MCG53738, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm1bQ8CC62 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Teddm1bQ8CC62 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Teddm1bQ8CC62 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Teddm1bQ8CC62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Teddm1bQ8CC62 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Teddm1bQ8CC62 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Teddm1bQ8CC62 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Teddm1bQ8CC62 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Teddm1bQ8CC62 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Teddm1bQ8CC62 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Teddm1bQ8CC62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Teddm1bQ8CC62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Teddm1bQ8CC62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms