Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo48Q8CAT8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo48Q8CAT8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo48Q8CAT8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo48Q8CAT8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo48Q8CAT8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo48Q8CAT8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo48Q8CAT8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo48Q8CAT8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo48Q8CAT8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo48Q8CAT8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo48Q8CAT8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo48Q8CAT8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo48Q8CAT8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo48Q8CAT8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo48Q8CAT8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo48Q8CAT8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo48Q8CAT8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo48Q8CAT8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo48Q8CAT8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo48Q8CAT8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxo48Q8CAT8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo48Q8CAT8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms