Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Parp9Q8CAS9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp9Q8CAS9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Parp9Q8CAS9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Parp9Q8CAS9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Parp9Q8CAS9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Parp9Q8CAS9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Parp9Q8CAS9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Parp9Q8CAS9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp9Q8CAS9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Parp9Q8CAS9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp9Q8CAS9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp9Q8CAS9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp9Q8CAS9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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