Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TiparpQ8C1B2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TiparpQ8C1B2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TiparpQ8C1B2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TiparpQ8C1B2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TiparpQ8C1B2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TiparpQ8C1B2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TiparpQ8C1B2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms