Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc169Q8BXX9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc169Q8BXX9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc169Q8BXX9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc169Q8BXX9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc169Q8BXX9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc169Q8BXX9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc169Q8BXX9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc169Q8BXX9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc169Q8BXX9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc169Q8BXX9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc169Q8BXX9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc169Q8BXX9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc169Q8BXX9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc169Q8BXX9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1372.2 ms