Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp5Q8BX09 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbbp5Q8BX09 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbbp5Q8BX09 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbbp5Q8BX09 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbbp5Q8BX09 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbbp5Q8BX09 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms