Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SprnQ8BWU1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SprnQ8BWU1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SprnQ8BWU1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SprnQ8BWU1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SprnQ8BWU1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SprnQ8BWU1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SprnQ8BWU1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SprnQ8BWU1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SprnQ8BWU1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SprnQ8BWU1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprnQ8BWU1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms