Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ6

UPF0505 protein C16orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BWQ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8BWQ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8BWQ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q8BWQ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8BWQ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8BWQ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8BWQ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q8BWQ6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8BWQ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BWQ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BWQ6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BWQ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BWQ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BWQ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BWQ6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BWQ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms