Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dclk3Q8BWQ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dclk3Q8BWQ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dclk3Q8BWQ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Dclk3Q8BWQ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dclk3Q8BWQ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dclk3Q8BWQ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dclk3Q8BWQ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dclk3Q8BWQ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dclk3Q8BWQ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dclk3Q8BWQ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dclk3Q8BWQ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dclk3Q8BWQ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dclk3Q8BWQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dclk3Q8BWQ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Dclk3Q8BWQ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dclk3Q8BWQ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dclk3Q8BWQ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms