Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms