Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU4

Clec9a, C-type lectin domain family 9 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec9aQ8BRU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec9aQ8BRU4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec9aQ8BRU4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec9aQ8BRU4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec9aQ8BRU4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec9aQ8BRU4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec9aQ8BRU4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms