Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRT5

A830005F24Rik, RIKEN cDNA A830005F24, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A830005F24RikQ8BRT5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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A830005F24RikQ8BRT5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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A830005F24RikQ8BRT5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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A830005F24RikQ8BRT5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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A830005F24RikQ8BRT5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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