Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap4Q8BMK4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap4Q8BMK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap4Q8BMK4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap4Q8BMK4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap4Q8BMK4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap4Q8BMK4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap4Q8BMK4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms