Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm9sf4Q8BH24 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf4Q8BH24 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm9sf4Q8BH24 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm9sf4Q8BH24 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf4Q8BH24 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf4Q8BH24 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf4Q8BH24 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tm9sf4Q8BH24 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm9sf4Q8BH24 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms