Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM7

Prkag3, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag3Q8BGM7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkag3Q8BGM7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkag3Q8BGM7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkag3Q8BGM7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkag3Q8BGM7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkag3Q8BGM7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkag3Q8BGM7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkag3Q8BGM7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prkag3Q8BGM7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkag3Q8BGM7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkag3Q8BGM7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkag3Q8BGM7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkag3Q8BGM7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkag3Q8BGM7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkag3Q8BGM7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkag3Q8BGM7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkag3Q8BGM7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkag3Q8BGM7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkag3Q8BGM7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkag3Q8BGM7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkag3Q8BGM7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkag3Q8BGM7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkag3Q8BGM7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms