Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
U2af1l4Q8BGJ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
U2af1l4Q8BGJ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
U2af1l4Q8BGJ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1l4Q8BGJ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1l4Q8BGJ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af1l4Q8BGJ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
U2af1l4Q8BGJ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
U2af1l4Q8BGJ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2af1l4Q8BGJ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2af1l4Q8BGJ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
U2af1l4Q8BGJ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2af1l4Q8BGJ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2af1l4Q8BGJ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2af1l4Q8BGJ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2af1l4Q8BGJ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2af1l4Q8BGJ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2af1l4Q8BGJ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2af1l4Q8BGJ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2af1l4Q8BGJ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2af1l4Q8BGJ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2af1l4Q8BGJ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2af1l4Q8BGJ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2af1l4Q8BGJ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms