Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc181Q80ZU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc181Q80ZU5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc181Q80ZU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc181Q80ZU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc181Q80ZU5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc181Q80ZU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc181Q80ZU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc181Q80ZU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc181Q80ZU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc181Q80ZU5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc181Q80ZU5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc181Q80ZU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc181Q80ZU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms