Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo1Q80ZD8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Amigo1Q80ZD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amigo1Q80ZD8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Amigo1Q80ZD8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms