Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Srrm3Q80WV7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srrm3Q80WV7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm3Q80WV7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm3Q80WV7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Srrm3Q80WV7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm3Q80WV7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm3Q80WV7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms