Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR5

UPF0688 protein C1orf174 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80WR5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q80WR5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q80WR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q80WR5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q80WR5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q80WR5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q80WR5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q80WR5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q80WR5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q80WR5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q80WR5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q80WR5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q80WR5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q80WR5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Q80WR5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q80WR5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q80WR5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q80WR5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q80WR5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q80WR5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q80WR5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q80WR5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q80WR5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q80WR5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q80WR5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80WR5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80WR5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80WR5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80WR5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80WR5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80WR5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80WR5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80WR5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80WR5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80WR5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80WR5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80WR5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Q80WR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q80WR5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q80WR5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q80WR5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Q80WR5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q80WR5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q80WR5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q80WR5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q80WR5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q80WR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q80WR5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q80WR5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q80WR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q80WR5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q80WR5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q80WR5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q80WR5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q80WR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q80WR5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q80WR5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q80WR5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q80WR5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q80WR5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q80WR5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q80WR5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Q80WR5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q80WR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q80WR5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Q80WR5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q80WR5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q80WR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q80WR5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q80WR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q80WR5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q80WR5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q80WR5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q80WR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q80WR5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q80WR5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q80WR5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q80WR5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q80WR5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q80WR5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q80WR5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q80WR5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q80WR5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q80WR5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q80WR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q80WR5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q80WR5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q80WR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q80WR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q80WR5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q80WR5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q80WR5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q80WR5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q80WR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q80WR5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q80WR5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q80WR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q80WR5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q80WR5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q80WR5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms