Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40,26■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40,26■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40,26■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40,25■■■■■ 4,03
AknaQ80VW7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
AknaQ80VW7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
AknaQ80VW7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40,22■■■■■ 4,03
AknaQ80VW7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
AknaQ80VW7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
AknaQ80VW7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40,19■■■■■ 4,02
AknaQ80VW7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
AknaQ80VW7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
AknaQ80VW7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,17■■■■■ 4,02
AknaQ80VW7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
AknaQ80VW7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40,13■■■■■ 4,01
AknaQ80VW7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,13■■■■■ 4,01
AknaQ80VW7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40,07■■■■■ 4
AknaQ80VW7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40,04■■■■■ 4
AknaQ80VW7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,03■■■■■ 4
AknaQ80VW7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,03■■■■■ 4
AknaQ80VW7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40,01■■■■■ 4
AknaQ80VW7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
AknaQ80VW7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
AknaQ80VW7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39,99■■■■□ 3,99
AknaQ80VW7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39,98■■■■□ 3,99
AknaQ80VW7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
AknaQ80VW7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
AknaQ80VW7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39,95■■■■□ 3,99
AknaQ80VW7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
AknaQ80VW7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,94■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39,92■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39,9■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39,89■■■■□ 3,98
AknaQ80VW7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
AknaQ80VW7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39,88■■■■□ 3,97
AknaQ80VW7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
AknaQ80VW7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39,87■■■■□ 3,97
AknaQ80VW7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
AknaQ80VW7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
AknaQ80VW7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39,85■■■■□ 3,97
AknaQ80VW7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39,85■■■■□ 3,97
AknaQ80VW7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
AknaQ80VW7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
AknaQ80VW7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
AknaQ80VW7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
AknaQ80VW7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
AknaQ80VW7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39,77■■■■□ 3,96
AknaQ80VW7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
AknaQ80VW7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,75■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
AknaQ80VW7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
AknaQ80VW7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
AknaQ80VW7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39,66■■■■□ 3,94
AknaQ80VW7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39,65■■■■□ 3,94
AknaQ80VW7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39,65■■■■□ 3,94
AknaQ80VW7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,94
AknaQ80VW7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,94
AknaQ80VW7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39,63■■■■□ 3,93
AknaQ80VW7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
AknaQ80VW7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
AknaQ80VW7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,93
AknaQ80VW7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39,56■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39,56■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC39,55■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC39,53■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC39,52■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39,52■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39,51■■■■□ 3,92
AknaQ80VW7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,48■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC39,48■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39,47■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,46■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39,45■■■■□ 3,91
AknaQ80VW7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms