Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnma8aQ80VM8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnma8aQ80VM8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pnma8aQ80VM8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnma8aQ80VM8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pnma8aQ80VM8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pnma8aQ80VM8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms