Protein–RNA interactions for Protein: Q80V63

Prdm4, PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4Q80V63 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm4Q80V63 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm4Q80V63 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm4Q80V63 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm4Q80V63 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm4Q80V63 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm4Q80V63 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm4Q80V63 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm4Q80V63 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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