Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rusc2Q80U22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rusc2Q80U22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rusc2Q80U22 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rusc2Q80U22 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rusc2Q80U22 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Rusc2Q80U22 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rusc2Q80U22 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rusc2Q80U22 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rusc2Q80U22 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rusc2Q80U22 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rusc2Q80U22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rusc2Q80U22 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rusc2Q80U22 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rusc2Q80U22 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rusc2Q80U22 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rusc2Q80U22 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rusc2Q80U22 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rusc2Q80U22 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Rusc2Q80U22 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Rusc2Q80U22 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rusc2Q80U22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rusc2Q80U22 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rusc2Q80U22 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rusc2Q80U22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Rusc2Q80U22 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Rusc2Q80U22 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
Rusc2Q80U22 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rusc2Q80U22 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rusc2Q80U22 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rusc2Q80U22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rusc2Q80U22 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Rusc2Q80U22 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Rusc2Q80U22 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Rusc2Q80U22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Rusc2Q80U22 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Rusc2Q80U22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Rusc2Q80U22 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Rusc2Q80U22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Rusc2Q80U22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Rusc2Q80U22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Rusc2Q80U22 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Rusc2Q80U22 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
Rusc2Q80U22 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Rusc2Q80U22 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Rusc2Q80U22 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Rusc2Q80U22 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Rusc2Q80U22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.11
Rusc2Q80U22 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Rusc2Q80U22 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Rusc2Q80U22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rusc2Q80U22 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rusc2Q80U22 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Rusc2Q80U22 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Rusc2Q80U22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms