Protein–RNA interactions for Protein: Q80TF4

Klhl13, Kelch-like protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl13Q80TF4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl13Q80TF4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl13Q80TF4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl13Q80TF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl13Q80TF4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl13Q80TF4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl13Q80TF4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl13Q80TF4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl13Q80TF4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl13Q80TF4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl13Q80TF4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl13Q80TF4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl13Q80TF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl13Q80TF4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl13Q80TF4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms