Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sys1Q78S06 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sys1Q78S06 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sys1Q78S06 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sys1Q78S06 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sys1Q78S06 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms