Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
March6Q6ZQ89 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
March6Q6ZQ89 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
March6Q6ZQ89 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
March6Q6ZQ89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
March6Q6ZQ89 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
March6Q6ZQ89 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
March6Q6ZQ89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
March6Q6ZQ89 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
March6Q6ZQ89 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
March6Q6ZQ89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
March6Q6ZQ89 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms