Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot1Q6ZQ08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot1Q6ZQ08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cnot1Q6ZQ08 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot1Q6ZQ08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot1Q6ZQ08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot1Q6ZQ08 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot1Q6ZQ08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot1Q6ZQ08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot1Q6ZQ08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot1Q6ZQ08 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot1Q6ZQ08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms