Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssxb3Q6XAS4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ssxb3Q6XAS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssxb3Q6XAS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb3Q6XAS4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb3Q6XAS4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssxb3Q6XAS4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb3Q6XAS4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssxb3Q6XAS4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms