Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cxcl3Q6W5C0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl3Q6W5C0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl3Q6W5C0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl3Q6W5C0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl3Q6W5C0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl3Q6W5C0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms