Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hsh2dQ6VYH9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hsh2dQ6VYH9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hsh2dQ6VYH9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hsh2dQ6VYH9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hsh2dQ6VYH9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms