Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
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