Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp8b3Q6UQ17 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp8b3Q6UQ17 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Atp8b3Q6UQ17 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp8b3Q6UQ17 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp8b3Q6UQ17 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp8b3Q6UQ17 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp8b3Q6UQ17 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp8b3Q6UQ17 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms