Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timd4Q6U7R4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timd4Q6U7R4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Timd4Q6U7R4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Timd4Q6U7R4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timd4Q6U7R4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Timd4Q6U7R4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timd4Q6U7R4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms