Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDH0

Phldb1, Pleckstrin homology-like domain family B member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb1Q6PDH0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Phldb1Q6PDH0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Phldb1Q6PDH0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Phldb1Q6PDH0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Phldb1Q6PDH0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Phldb1Q6PDH0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Phldb1Q6PDH0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Phldb1Q6PDH0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
Phldb1Q6PDH0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
Phldb1Q6PDH0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Phldb1Q6PDH0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Phldb1Q6PDH0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Phldb1Q6PDH0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Phldb1Q6PDH0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Phldb1Q6PDH0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Phldb1Q6PDH0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Phldb1Q6PDH0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Phldb1Q6PDH0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Phldb1Q6PDH0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Phldb1Q6PDH0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Phldb1Q6PDH0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Phldb1Q6PDH0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Phldb1Q6PDH0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Phldb1Q6PDH0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Phldb1Q6PDH0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Phldb1Q6PDH0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Phldb1Q6PDH0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Phldb1Q6PDH0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Phldb1Q6PDH0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Phldb1Q6PDH0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC43.95■■■■■ 4.63
Phldb1Q6PDH0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.94■■■■■ 4.63
Phldb1Q6PDH0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Phldb1Q6PDH0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Phldb1Q6PDH0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Phldb1Q6PDH0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Phldb1Q6PDH0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Phldb1Q6PDH0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Phldb1Q6PDH0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
Phldb1Q6PDH0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Phldb1Q6PDH0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Phldb1Q6PDH0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Phldb1Q6PDH0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Phldb1Q6PDH0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Phldb1Q6PDH0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Phldb1Q6PDH0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Phldb1Q6PDH0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Phldb1Q6PDH0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Phldb1Q6PDH0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Phldb1Q6PDH0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Phldb1Q6PDH0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Phldb1Q6PDH0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Phldb1Q6PDH0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Phldb1Q6PDH0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Phldb1Q6PDH0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Phldb1Q6PDH0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Phldb1Q6PDH0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Phldb1Q6PDH0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Phldb1Q6PDH0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Phldb1Q6PDH0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Phldb1Q6PDH0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Phldb1Q6PDH0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Phldb1Q6PDH0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Phldb1Q6PDH0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Phldb1Q6PDH0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Phldb1Q6PDH0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Phldb1Q6PDH0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC43.46■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Phldb1Q6PDH0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Phldb1Q6PDH0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Phldb1Q6PDH0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Phldb1Q6PDH0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
Phldb1Q6PDH0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Phldb1Q6PDH0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
Phldb1Q6PDH0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Phldb1Q6PDH0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Phldb1Q6PDH0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Phldb1Q6PDH0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
Phldb1Q6PDH0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
Phldb1Q6PDH0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Phldb1Q6PDH0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Phldb1Q6PDH0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Phldb1Q6PDH0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms