Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rtl3Q6P1Y1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl3Q6P1Y1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl3Q6P1Y1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl3Q6P1Y1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rtl3Q6P1Y1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtl3Q6P1Y1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtl3Q6P1Y1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtl3Q6P1Y1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtl3Q6P1Y1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtl3Q6P1Y1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl3Q6P1Y1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl3Q6P1Y1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl3Q6P1Y1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.5 ms