Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Szrd1Q6NXN1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Szrd1Q6NXN1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Szrd1Q6NXN1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Szrd1Q6NXN1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Szrd1Q6NXN1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Szrd1Q6NXN1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Szrd1Q6NXN1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Szrd1Q6NXN1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms