Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
2810408A11RikQ6NSU2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
2810408A11RikQ6NSU2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2810408A11RikQ6NSU2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2810408A11RikQ6NSU2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
2810408A11RikQ6NSU2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2810408A11RikQ6NSU2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2810408A11RikQ6NSU2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms