Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5416Q6IE28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5416Q6IE28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5416Q6IE28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5416Q6IE28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5416Q6IE28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5416Q6IE28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5416Q6IE28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5416Q6IE28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5416Q6IE28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms