Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK9

Nlgn2, Neuroligin-2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn2Q69ZK9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nlgn2Q69ZK9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlgn2Q69ZK9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlgn2Q69ZK9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nlgn2Q69ZK9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlgn2Q69ZK9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nlgn2Q69ZK9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlgn2Q69ZK9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlgn2Q69ZK9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlgn2Q69ZK9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nlgn2Q69ZK9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nlgn2Q69ZK9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nlgn2Q69ZK9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nlgn2Q69ZK9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlgn2Q69ZK9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlgn2Q69ZK9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlgn2Q69ZK9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlgn2Q69ZK9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlgn2Q69ZK9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlgn2Q69ZK9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlgn2Q69ZK9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlgn2Q69ZK9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nlgn2Q69ZK9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn2Q69ZK9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nlgn2Q69ZK9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nlgn2Q69ZK9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn2Q69ZK9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn2Q69ZK9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlgn2Q69ZK9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlgn2Q69ZK9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlgn2Q69ZK9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlgn2Q69ZK9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nlgn2Q69ZK9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nlgn2Q69ZK9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlgn2Q69ZK9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms