Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CilpQ66K08 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CilpQ66K08 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CilpQ66K08 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CilpQ66K08 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CilpQ66K08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CilpQ66K08 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CilpQ66K08 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms