Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup62Q63850 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nup62Q63850 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup62Q63850 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup62Q63850 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup62Q63850 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms