Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic2Q62520 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zic2Q62520 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zic2Q62520 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zic2Q62520 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zic2Q62520 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zic2Q62520 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zic2Q62520 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zic2Q62520 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zic2Q62520 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zic2Q62520 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zic2Q62520 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms