Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ndrg1Q62433 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndrg1Q62433 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndrg1Q62433 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ndrg1Q62433 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndrg1Q62433 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndrg1Q62433 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndrg1Q62433 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms